Koivistosta on myös muistettava hänen merkittävä kommunismin vastainen toimintansa Turussa. Sosialidemokraatit ja kommunistit taistelivat vallasta erilaisissa työväenyhdistyksissä ja ammattiyhdistyksissä 1940- ja 1950-luvuilla. Professori Timo Soikkasen mukaan Mauno Koivisto lähetettiin taitavana puhujana erilaisiin kokouksiin puolustamaan sosialidemokraatteja yhdistyksiä valtaamaan pyrkiviä kommunisteja vastaan. Koiviston työ Turun satamassa satamakonttorin hoitajana liittyi myös osittain sosialidemokraattien ja kommunistien väliseen taisteluun vallasta siellä. Hän kävi myös toisissa satamissa samalla asialla.